L'histoire de Naruto Shippuden se déroule 3 ans après le départ de Naruto à Konoha. On y retrouve tout les personnages plus murs et plus âgés.
L'intrigue tourne autour des aventures de Sakura et Naruto à la recherches de Sasuke, parti de Konoha pour acquérir de nouveaux pouvoirs, mais on y découvre aussi les objectifs de l'Akatsuki.
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Episode 01 - Le retour à la maison
Episode 02 - Akatsuki en action
Episode 03 - Les fruits de l'entraînement
Episode 04 - Le Jinchuriki de Suna
Episode 05 - En tant que Kazekage ...!
Episode 06 - Mission accomplie
Episode 07 - Cours, Kankurô
Episode 08 - L'équipe Kakashi en mouvement
Episode 09 - Les larmes du Jinchûriki
Episode 10 - Technique de scellement : Les neufs sceaux illusoires du dragon
